La conquista bizantina di Napoli nel 536 non chiuse definitivamente la partita per il controllo della città: la guerra gotica, uno dei conflitti più lunghi e sanguinosi della tarda antichità italiana, sarebbe proseguita per quasi vent'anni ancora, e Napoli sarebbe tornata più volte al centro degli eventi militari.
Intorno al 543 dopo Cristo, sotto la guida del nuovo re ostrogoto Totila — figura che le fonti bizantine descrivono come abile stratega, capace di ricompattare le forze gotiche dopo le sconfitte iniziali — Napoli tornò a essere assediata, questa volta dalle truppe gotiche intenzionate a riprendere il controllo della città e del suo porto strategico.
La guarnigione bizantina presente in città, secondo le fonti, non ricevette rinforzi adeguati in tempo utile, e dopo un assedio prolungato — che secondo Procopio provocò gravi difficoltà di approvvigionamento tra la popolazione civile — Napoli passò nuovamente sotto controllo goto, in un capovolgimento che testimonia quanto fossero fluide e mutevoli le sorti del conflitto in questa fase della guerra.
Gli anni della guerra gotica, con le loro conquiste e riconquiste successive, lasciarono la città profondamente provata: la popolazione si ridusse sensibilmente, le infrastrutture urbane subirono danni, e l'intera area campana attraversò una fase di crisi economica e demografica che avrebbe pesato a lungo sullo sviluppo successivo della regione.
La guerra gotica si sarebbe conclusa solo alcuni anni più tardi, intorno al 552-553, con la vittoria definitiva delle forze bizantine guidate dal generale Narsete e la conseguente riconquista dell'intera Italia meridionale, Napoli inclusa, sotto il controllo di Costantinopoli: l'inizio della lunga stagione bizantina della città, destinata a durare, seppur con crescente autonomia locale, per diversi secoli a venire.
Nel Capitolo 22 concluderemo questa fase della nostra storia con uno sguardo d'insieme sull'eredità lasciata da otto secoli di storia greco-romana a Napoli, proprio alla vigilia della nascita del Ducato che avrebbe segnato l'inizio della sua storia altomedievale.